（1）基于國(guó)外大宗進(jìn)口商品向國(guó)內(nèi)市場(chǎng)分銷的物流運(yùn)作模式
國(guó)際大宗進(jìn)口商品利用保稅區(qū)作為物流分撥基地，面向國(guó)內(nèi)市場(chǎng)開(kāi)展分銷活動(dòng)，是目前一些跨國(guó)公司和具有較強(qiáng)專業(yè)性國(guó)際企業(yè)在中國(guó)市場(chǎng)的一種主要運(yùn)作方式。以保稅區(qū)為分撥基地的物流活動(dòng)，其主要的好處有：1）緩征進(jìn)口關(guān)稅，減少企業(yè)的資金占用；2）能夠根據(jù)客戶要求及時(shí)報(bào)關(guān)進(jìn)口手續(xù)，保證現(xiàn)貨交易，避免交貨延誤；3）利用中國(guó)保稅區(qū)低成本的物流及相關(guān)服務(wù)設(shè)施，降低分銷活動(dòng)中物流成本；4）便于開(kāi)展售后服務(wù)，提高客戶服務(wù)質(zhì)量?？傊?，利用保稅區(qū)作為分撥物流基地，可以從整體上降低國(guó)際進(jìn)口商品在中國(guó)的銷售成本、提高服務(wù)效率和質(zhì)量。
此類物流業(yè)務(wù)對(duì)保稅區(qū)物流功能的需求，主要是以倉(cāng)儲(chǔ)、配送、報(bào)關(guān)服務(wù)、簡(jiǎn)單流通加工和物流信息服務(wù)為主。
（2）基于國(guó)內(nèi)出口商品在保稅區(qū)集結(jié)和配送的物流業(yè)務(wù)運(yùn)作模式
隨著全球經(jīng)濟(jì)一體化進(jìn)程的加快和中國(guó)商品國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)能力的提高，跨國(guó)采購(gòu)活動(dòng)已日益頻繁地出現(xiàn)在中國(guó)市場(chǎng)，許多生產(chǎn)性跨國(guó)公司、國(guó)際大型零售企業(yè)和專業(yè)化國(guó)際采購(gòu)公司的國(guó)際采購(gòu)網(wǎng)絡(luò)正在向中國(guó)延伸，并在我國(guó)沿海地區(qū)的大型港口城市，特別這些地區(qū)的保稅區(qū)中開(kāi)始建立國(guó)際采購(gòu)中心，將從中國(guó)市場(chǎng)采購(gòu)的商品源源不斷地輸往世界各地，進(jìn)一步帶動(dòng)了我國(guó)出口的活躍和發(fā)展。此外，國(guó)內(nèi)一些新興的企業(yè)集團(tuán)和貿(mào)易公司也在加大開(kāi)拓市場(chǎng)的力度整合出口渠道和資源，開(kāi)始重視利用保稅區(qū)作為出口商品的集配中心。因此，基于出口商品集散的物流業(yè)務(wù)就成為保稅區(qū)物流運(yùn)作又一主要方式。
保稅區(qū)出口商品集散物流運(yùn)作的其主要的優(yōu)勢(shì)是，1）便于根據(jù)國(guó)際市場(chǎng)生產(chǎn)和銷售需求，提供配套商品和服務(wù)；2）出口企業(yè)能夠在商品離境之前享受出口退稅、結(jié)匯等貿(mào)易促進(jìn)政策，加快資金周轉(zhuǎn)；3）便于利用保稅區(qū)低成本的物流及相關(guān)服務(wù)設(shè)施，降低分銷活動(dòng)中物流成本；4）降低出口企業(yè)的市場(chǎng)風(fēng)險(xiǎn)，縮短理賠、補(bǔ)貨以及調(diào)換商品的時(shí)間，減少出口企業(yè)的損失。
出口商品集散中心的物流功能除基本的倉(cāng)儲(chǔ)、運(yùn)輸、流通加工、報(bào)關(guān)服務(wù)及信息服務(wù)等基本服務(wù)和增值服務(wù)之外，還需要提供商品檢驗(yàn)服務(wù)，以在保稅區(qū)這樣的境內(nèi)關(guān)外區(qū)域發(fā)現(xiàn)出口商品的問(wèn)題，并在貨物離境出區(qū)之前完成可能出現(xiàn)的理賠、退貨、補(bǔ)貨、調(diào)換等出口后序工作。
（3）基于加工貿(mào)易的國(guó)外原材料進(jìn)口與制成品出口的物流業(yè)務(wù)運(yùn)作模式
加工貿(mào)易是我國(guó)國(guó)際貿(mào)易中最為重要的貿(mào)易方式之一，也是支撐我國(guó)保稅區(qū)發(fā)展、特別是物流功能發(fā)展的主要?jiǎng)恿?。從保稅區(qū)的實(shí)際運(yùn)行情況來(lái)看，與加工貿(mào)易有關(guān)的物流活動(dòng)可以分為兩種類型：一是與非保稅區(qū)加工貿(mào)易企業(yè)從國(guó)際市場(chǎng)進(jìn)口原材料有關(guān)的物流活動(dòng)，以及與制成品向國(guó)際市場(chǎng)和國(guó)內(nèi)市場(chǎng)銷售相關(guān)的物流活動(dòng)；二是保稅區(qū)內(nèi)加工企業(yè)的利用進(jìn)口和國(guó)內(nèi)市場(chǎng)的原材料的物流活動(dòng)，及其制成品向國(guó)際市場(chǎng)出口和國(guó)內(nèi)市場(chǎng)銷售出口的物流活動(dòng)。由此可見(jiàn)，加工貿(mào)易企業(yè)進(jìn)出口活動(dòng)所帶動(dòng)的物流活動(dòng)是非常頻繁的，其物流業(yè)務(wù)的運(yùn)作形式也比較多樣化。
（4）基于轉(zhuǎn)口貿(mào)易的物流運(yùn)作模式
同國(guó)際自由貿(mào)易區(qū)一樣，轉(zhuǎn)口貿(mào)易是保稅區(qū)的又一重要功能。轉(zhuǎn)口貿(mào)易的開(kāi)展和擴(kuò)大，受到多方面因素的影響：一是保稅區(qū)（或自由貿(mào)易區(qū)）應(yīng)在區(qū)域市場(chǎng)中具有較好的地理區(qū)位優(yōu)勢(shì)；二是保稅區(qū)能夠提供進(jìn)出自由的制度環(huán)境和便利條件；三是保稅區(qū)應(yīng)位于區(qū)域或世界交通樞紐，具有良好的運(yùn)輸條件和物流設(shè)施；四是保稅區(qū)的物流運(yùn)作成本相對(duì)較低；五是保稅區(qū)及港口、海關(guān)等方面的管理效率較高。
轉(zhuǎn)口貿(mào)易的物流運(yùn)作是以區(qū)內(nèi)第三方物流企業(yè)為主體，其物流業(yè)務(wù)的主要內(nèi)容是為轉(zhuǎn)口過(guò)境商品提供倉(cāng)儲(chǔ)、多式聯(lián)運(yùn)、城市物流分撥以及物流信息服務(wù)等。
（5）基于國(guó)際商品展示的物流業(yè)務(wù)運(yùn)作模式
保稅區(qū)的國(guó)際商品展示功能是擴(kuò)大保稅區(qū)貿(mào)易進(jìn)口和加工貿(mào)易增長(zhǎng)的一個(gè)重要的輔助功能。特別是隨著中國(guó)成為wto成員國(guó)，中國(guó)市場(chǎng)的進(jìn)一步開(kāi)放會(huì)帶來(lái)更多的國(guó)際商品進(jìn)入中國(guó)市場(chǎng)。保稅區(qū)通過(guò)為企業(yè)提供商品展示功能和交易服務(wù)功能，可以促進(jìn)保稅區(qū)貿(mào)易活動(dòng)的開(kāi)展，增加保稅區(qū)物流流量。
以國(guó)際商品展示為基礎(chǔ)的物流運(yùn)作基本類似于大宗進(jìn)口商品的分撥和配送物流，但運(yùn)作主體是保稅區(qū)內(nèi)的物流企業(yè)，進(jìn)口物流的批量將隨國(guó)際國(guó)內(nèi)需求的增長(zhǎng)逐步增大。