物流資源利用率低
一方面因?yàn)閭鹘y(tǒng)的倉(cāng)庫(kù)因其在倉(cāng)儲(chǔ)凈空高度往往得不到利用而造成大量空間資源的閑置浪費(fèi);另一方面因?yàn)閭鹘y(tǒng)倉(cāng)庫(kù)的管理和作業(yè)模式均采用原始的作業(yè)方式，倉(cāng)庫(kù)設(shè)備的能力沒(méi)有充分發(fā)揮出來(lái)，在一定程度上也造成了浪費(fèi)。
作業(yè)質(zhì)量引起的損耗大
一方面是傳統(tǒng)的平面?zhèn)}庫(kù)物流自動(dòng)化水平較低，貨物的進(jìn)入庫(kù)基本是人工利用叉車進(jìn)行作業(yè)，而由于人工操作不當(dāng)會(huì)造成貨物碰撞損耗;另一方面是因?yàn)殄e(cuò)誤作業(yè)或錯(cuò)誤配送所引起的錯(cuò)誤成本，特別是藥品的配送，會(huì)引起更嚴(yán)重的后果。
信息流和物流不一致
一方面?zhèn)鹘y(tǒng)的倉(cāng)庫(kù)往往信息化程度較低，導(dǎo)致整體物流管理水平低下，無(wú)法向客戶提供優(yōu)質(zhì)和靈活的物流服務(wù)。另一方面會(huì)因信息流和物流無(wú)法統(tǒng)一而造成上面所述的錯(cuò)誤成本，使總體倉(cāng)儲(chǔ)成本提高。
作業(yè)效率低下
傳統(tǒng)的平面?zhèn)}庫(kù)是“人工一叉車一貨架”的作業(yè)模式，其作業(yè)速度根本無(wú)法與自動(dòng)化立體倉(cāng)庫(kù)中的“計(jì)算機(jī)一堆垛機(jī)一貨架”的作業(yè)模式相比，大大影響第三方物流企業(yè)的競(jìng)爭(zhēng)能力。